在传统的试管婴儿过程中，往往采用移植培养第三天的初级胚胎（含有2～8个细胞），而目前世界先进的生殖实验室，则选用移植培养到第5～6天的囊胚（含有几百个细胞）进行移植。两种方案各有自己的特点，简单的来说，初级胚胎培植技术简单，但是移植成功率低；而囊胚培植技术要求高，但是移植成功率高。因此，在条件允许的情况下，因优先考虑采用囊胚进行移植。
人类胚胎的发育，从一个受精卵分裂为两个、四个、八个、十六个细胞，然后再发育成为囊胚。囊胚是完全发育了的胚胎，在医生将其植入患者子宫后可以马上准备着床。 如下所示：
精子和卵子受精后形成一个细胞的胚胎 胚胎分裂为两个细胞
胚胎分裂为四个细胞 胚胎分裂为八个细胞
胚胎分裂为十六个细胞 胚胎发育到囊胚
囊胚从透明带中伸张孵化出来
在以前技术不够先进，胚胎培养液也未普及的时候，实验室胚胎培养仅培养2-3天，到胚胎发育至2-8个细胞的初级胚胎阶段，医生就会将胚胎植入患者子宫。1998年，Gardner发明了可以让科学家进行囊胚培养的序列培养基。由特定的营养物质组成一系列的序列培养基，能提供模拟自然状态下，胚胎在各个阶段所需的不同类型与含量的营养物质。因此，在培育囊胚的5天里，需要定期为胚胎更换最适合的培养液，让胚胎可以吸收到在输卵管和子腔中自然发育一样的营养物质。
除了序列培养基的不断发展，现有的胚胎培养技术也有了许多新的发展和进步，提高囊胚的培养成功率。 这些技术包括在实验室内，控制各种气体比例、温度、光照、酸碱度及相应的序列营养基，在一个可控的且已经调整到适合胚胎每一个阶段发育的最佳环境中，将胚胎能够培养成几百个细胞的囊胚。
胚胎一般在受精后的第五天发育到囊胚，选择移植囊胚的原因是因为囊胚着床能力最强，多年的研究表明，囊胚移植拥有更高的移植成功率和怀孕率。
试管婴儿技术的第一步，胚胎培植
通过试管婴儿技术治疗不孕不育，在注射一定量促排卵药物后，通过手术将卵子取出体外。所取到的卵子先经过专业人员的挑选，选择成熟的卵子用于和精子受精，而未成熟的卵子则被淘汰。一般情况下，百分之七十的成熟卵子和精子能够成功受精结合形成受精卵，在受精卵分裂至2-8个细胞的时期，有一部分胚胎因为存在某些异常而被自然淘汰，不能继续发育，最后死亡。传统的胚胎移植一般在胚胎发育到第三天开始移植，需要植入2-3个胚胎，有的甚至植入3个以上，增加了患者怀三胞胎以上的多胞胎妊娠风险。而将胚胎培养至囊胚阶段，能发育到囊胚阶段的胚胎都是生命力比较旺盛的胚胎，并且因为囊胚着床能力强，所以可以减少胚胎移植数量，不仅提高了移植后的成功率，还降低了多胞胎的风险。
通常情况下，能够经过体外受精最后发育到品质优良的胚胎数量，约占卵子总数量的三分之一。卵子数量对于试管婴儿成功率有很大影响，卵子数量越多越好。
移植囊胚的优点和缺点
优点是在胚胎发育至囊胚的过程中，自然淘汰掉了一些品质不好的胚胎，最后剩下能够发育到囊胚的胚胎移植回子宫。这样可以提高每次移植后成功着床率，减少每次移植回子宫的胚胎数量，降低多胞胎妊娠的风险。对于不需要的夫妇来说，可以只移植一个囊胚，而着床率与移植两个囊胚差不多。
缺点是囊胚培养过程对实验室要求比较高，并且对于卵子数目特别少的女性，囊胚培养的困难也较高。如果要让囊胚移植的成功率高于移植初级胚胎，要求具备特殊的胚胎培养系统，以及标准的胚胎培养实验室。在某些情况下，在细胞发育到初级胚胎时进行胚胎移植的成功率也不错。因为胚胎需要在子宫外的非自然环境下培养，如果实验室条件不达标，胚胎可能因受到外界环境影响而不能发育到囊胚阶段，最后没有胚胎可移植回子宫。
囊胚比例和女性年龄有关，年龄小的女性相比年龄大的女性能够得到囊胚的比例高。35岁以下的女性，囊胚占受精胚胎的比例约为50%，随着年龄的增加而降低。
移植初级胚胎和囊胚的优缺点比较
优点是胚胎不需要在胚胎培养箱内培养过久，降低了受到外界环境影响的风险，特别对于培养系统不够标准的实验室，时间越久对胚胎伤害越大，导致本来品质较好的胚胎无法发育至囊胚。所以对于胚胎数量不多的患者可以移植8个细胞的胚胎，胚胎的着床能力在于精子和卵子的质量，总的成功率也令人满意。
缺点是需要移植数量较多的胚胎，增加了多胞胎妊娠的风险。因为对于移植初级胚胎，减少胚胎移植数量可能会影响到成功率，但是对于囊胚移植不存在以上问题，一般移植不超过两个囊胚胚胎，最大限度上保证了不产生三胞胎或多胞胎妊娠（除非出现同卵的情况）。据统计，通过生殖辅助技术治疗不孕不育，因为治疗过程中的某些刺激，增加了出现同卵几率。
因此，无论是移植初级胚胎还是移植囊胚胚胎，需要根据实际情况选择采用，试管婴儿的成功与否主要取决于决定胚胎质量的精子和卵子品质。要选择移植哪个时期的胚胎，需要参考受精卵的数量、女方年龄、是否拥有专用于培养囊胚胚胎的试管婴儿实验室和培养系统。实验室条件较差或胚胎数量少的情况，移植初级胚胎是不得已的选择，但是如果一次移植数量过多，可能引起多胞胎妊娠问题。对于受精胚胎数量多的情况，移植囊胚胚胎可以帮我们挑选到品质好的胚胎，不需要同时移植多枚胚胎，降低了三胞胎或多胞胎的风险，而且移植后的怀孕成功率提高。
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